熒光顯微鏡照明方式通常為落射式，光源為紫外線，波長相對較短，但分辨能力高，由于熒光顯微鏡擁有兩片特殊的濾光片，能夠過濾可見光，起到保護眼睛的作用。隨著現代科技的快速發展，熒光顯微鏡被應用在醫療、衛生檢測、科研部門、電子工業、農林等領域，應用需求持續攀升。
根據新思界產業研究中心發布的
《2021-2026年熒光顯微鏡行業市場深度調研及投資前景預測分析報告》顯示，隨著應用范圍不斷拓寬，以近幾年環境監測、生命科學等產業的發展帶動，熒光顯微鏡市場需求持續攀升，市場規模隨之擴大。在2019年我國熒光顯微鏡市場規模約為60億元，在醫藥、環保、化學等產業發展持續推動，國內熒光顯微鏡市場規模仍舊持續攀升，預計到2024年達到128億元。
近些年我國對于科技經費投入力度不斷增加，從2017年的1.7萬億元，增長到2019年的2.2萬億元，同比上年增長了12.5%。在國家大力鼓勵科技創新的背景下，熒光顯微鏡市場需求增長的同時，熒光顯微鏡產品也在不斷創新，完成產業升級。
熒光顯微鏡主要被應用在生物醫學領域。熒光顯微鏡有多種類型，目前常用到的產品有普通熒光顯微鏡、激光掃描共聚焦顯微鏡、超分辨率顯微鏡、多光子激光掃描顯微鏡。
在全球中，我國是顯微鏡生產大國，但高端顯微鏡產能主要集中在日本和德國，主要生產企業有蔡司、奧林巴斯、徠卡顯微鏡系統、尼康等，占據全球高端顯微鏡市場的65%以上。且以上幾家企業布局領域不同，蔡司主要集中在消費光學和電子光學產品；徠卡集中在共聚焦顯微鏡、立體顯微鏡領域；奧林巴斯布局在生命科學領域；尼康在醫療鏡片和醫療影像設備領域布局。
以上四家顯微鏡龍頭企業，布局在各個細分領域，能夠滿足市場不同需求。我國顯微鏡生產企業缺乏技術沉淀，生產能力不足，目前能夠生產高端顯微鏡產品的企業有永新光學，麥克奧迪、舜宇光學。
新思界
產業分析人士表示，熒光顯微鏡較普通顯微鏡優勢明顯，主要被應用在生物醫學領域，在人口老齡化背景下，我國生物醫學產業快速發展，熒光顯微鏡市場需求攀升，行業發展前景較好。我國是顯微鏡生產大國，卻不是生產強國，高端顯微鏡市場被德國和日本企業占據，未來國產化空間較大。
