cRNA探針,是以cDNA為模板,通過體外轉(zhuǎn)錄獲得cRNA制備而成的一種單鏈探針,是一種核酸探針,屬于RNA探針。
cRNA探針的制備過程是,從組織或細(xì)胞中提取mRNA,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄作用獲得cDNA,對cDNA進(jìn)行克隆并連接到載體上,以克隆的cDNA為模板,以含有標(biāo)記物的核苷酸為原料,進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cRNA。在此過程中,cRNA的轉(zhuǎn)錄方向可以控制,能夠獲得帶有標(biāo)記物的與mRNA同序列的同義cRNA探針,或者與mRNA互補(bǔ)的反義cRNA探針。
cRNA探針的工作原理是,利用cRNA探針與樣品核酸分子進(jìn)行雜交,若樣品中含有與cRNA探針互補(bǔ)的核酸序列(即目標(biāo)核酸序列),則二者相互作用通過氫鍵緊密相連形成雙鏈,洗去未雜交的多余cRNA探針,基于標(biāo)記物的自顯影或者發(fā)光作用對樣品進(jìn)行檢測,獲得目標(biāo)核酸序列相關(guān)信息,即利用與cRNA探針檢測出與之互補(bǔ)的核酸序列。
根據(jù)新思界產(chǎn)業(yè)研究中心發(fā)布的
《2024-2028年cRNA探針行業(yè)深度市場調(diào)研及投資策略建議報告》顯示,cRNA探針是一種單鏈探針,不存在雙鏈探針存在的與目標(biāo)核酸序列雜交結(jié)合的有效探針數(shù)量減少,導(dǎo)致雜交效率與檢測靈敏度降低的弊端,具有雜交效率高的優(yōu)點,在分子雜交領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,特別是在原位雜交中應(yīng)用比例較高。
采用cRNA探針雜交形成的雙鏈穩(wěn)定性高,不會受RNA酶影響,而cRNA探針本身對RNA酶敏感,會被破壞,因此可以利用RNA酶來清除未雜交的多余cRNA探針,以排除干擾,便于后續(xù)對樣品進(jìn)行探測觀察。
cRNA探針可應(yīng)用范圍廣泛,包括檢測同種基因在不同條件下的表達(dá)水平、協(xié)助注釋未知基因組區(qū)域、研究基因組復(fù)制機(jī)制、檢測病毒的存在以及含量等。例如,利用地高辛標(biāo)記的cRNA探針,在胰腺切片上進(jìn)行原位雜交,可用來檢測胰島素基因表達(dá)產(chǎn)物mRNA,結(jié)果可靠性高。但cRNA探針制備過程較為復(fù)雜,對實驗設(shè)備、試驗環(huán)境、實驗人員技術(shù)要求較高。
新思界
行業(yè)分析人士表示,與歐美國家相比,我國基因研究起步較晚,但發(fā)展迅速,部分技術(shù)已經(jīng)達(dá)到或接近國際先進(jìn)水平。同時,為實現(xiàn)疾病早發(fā)現(xiàn)、早治療以及精準(zhǔn)治療,我國基因測序行業(yè)迅速崛起,特別是高通量測序(NGS)發(fā)展速度快,倒推基因研究技術(shù)不斷進(jìn)步。在此背景下,我國市場對核酸探針需求不斷增長,cRNA探針作為核酸探針的一種,未來市場前景良好。