cDNA探針,一般為單鏈核酸分子,因此也稱單鏈cDNA探針,是以互補(bǔ)于mRNA的DNA分子制作而成的探針,是核酸探針細(xì)分產(chǎn)品RNA探針的一種。
cDNA探針的制備過(guò)程可簡(jiǎn)單概括為,對(duì)相應(yīng)的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,獲得mRNA,再利用逆轉(zhuǎn)錄酶,使mRNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄作用得到cDNA,cDNA經(jīng)標(biāo)記物標(biāo)記后制備為探針。cDNA探針為單鏈,與目標(biāo)基因堿基順序互補(bǔ),可雜交形成雙鏈;在基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,內(nèi)含子序列會(huì)被剪切去除,因此cDNA探針不含內(nèi)含子序列。
cDNA也可以從cDNA文庫(kù)中克隆獲得,可以克隆單鏈cDNA、雙鏈cDNA。由于雙鏈cDNA制備而成的雙鏈cDNA探針,會(huì)使可以與目標(biāo)核酸序列雜交結(jié)合的有效探針數(shù)量減少,降低了雜交效率,同時(shí)也降低了檢測(cè)靈敏度,因此通常所說(shuō)cDNA探針一般為單鏈cDNA探針。
經(jīng)標(biāo)記物標(biāo)記的cDNA探針,與被測(cè)樣品中的核酸分子進(jìn)行雜交,若樣品中含有與探針互補(bǔ)的核酸序列,二者可雜交形成雙鏈,將未雜交的探針洗去,利用標(biāo)記物的自顯影或者發(fā)光特性進(jìn)行檢測(cè),可以獲得樣品中是否含有與cDNA探針互補(bǔ)的目標(biāo)核酸序列,以及目標(biāo)核酸序列的含量與位置等信息。
根據(jù)新思界產(chǎn)業(yè)研究中心發(fā)布的
《2024-2028年cDNA探針行業(yè)深度市場(chǎng)調(diào)研及投資策略建議報(bào)告》顯示,由于為單鏈核酸分子,且不含內(nèi)含子序列,cDNA探針具有雜交反應(yīng)敏感性高的優(yōu)點(diǎn),是理想的核酸探針產(chǎn)品,但制備難度較大,對(duì)其應(yīng)用形成一定限制,目前主要應(yīng)用于科研領(lǐng)域。但cDNA探針在檢測(cè)領(lǐng)域也有發(fā)展空間,例如利用cDNA探針可以檢測(cè)遺傳性疾病DMD(假肥大型進(jìn)行性肌營(yíng)養(yǎng)不良)患者的基因缺失。
在全球范圍內(nèi),cDNA探針提供商主要有德國(guó)默克集團(tuán)(Merck KGaA)、德國(guó)Greiner Bio-One GmbH、日本Takara Bio、美國(guó)賽默飛世爾(ThermoFisher)、美國(guó)伯樂(lè)(Bio-Rad Laboratories)、美國(guó)Enzo Life Sciences、美國(guó)NEB、美國(guó)Sequenom、美國(guó)Roche Nimblegen、美國(guó)Cepheid、美國(guó)安捷倫(Agilent)、美國(guó)因美納(Illumina)、美國(guó)Life Technologies Corporation、美國(guó)Affymetrix等。美國(guó)在全球cDNA探針市場(chǎng)中處于領(lǐng)先地位。
新思界
行業(yè)分析人士表示,廣義上的生物探針包括核酸探針、抗體探針兩種,其中,核酸探針為主流產(chǎn)品。核酸探針又包括DNA探針、RNA探針兩種,其中,DNA探針占據(jù)主導(dǎo)地位,RNA探針應(yīng)用占比較少。RNA探針包括單鏈cDNA探針、cRNA探針、寡核苷酸探針三種,各有優(yōu)缺點(diǎn)。總的來(lái)看,cDNA探針市場(chǎng)需求小,但在科研領(lǐng)域擁有發(fā)展空間。